Nucleic-Acid Amplification Test for STDs
Hvordan virker Nucleic Acid Amplification Tests?
Det finnes flere forskjellige typer nukleinsyre-amplifikasjonstester. Alle NAAT er imidlertid basert på de samme prinsippene. For det første må forskere finne ut sekvensen av nukleinsyrene de vil identifisere og lage prober som vil feste dem. Da bruker NAT en rekke gjentatte kjemiske reaksjoner for å lage mange kopier av DNA eller RNA som leger prøver å oppdage. Disse reaksjonene amplifiserer selektivt signalet til de interessante nukleinsyrene i testprøven slik at de er enklere å identifisere. Det er mye enklere å finne 10 000 eksemplarer av et gen enn 10.Hva har dette å gjøre med STD-testing?
Prosessen med å amplifisere bakterielle eller virale nukleinsyrer er ikke i seg selv STD-testen. I stedet, når mengden av DNA eller RNA har blitt økt i prøven ved hjelp av PCR eller LCR, brukes mer konvensjonelle tester for å oppdage det. Disse testene involverer vanligvis en form for nukleinsyrehybridisering. I disse testene blir prøven probet med en kunstig produsert komplementær streng av DNA eller RNA som er merket på en måte som gjør det enkelt å oppdage. Det kan bidra til å vise det som en glød i den mørke taggen som bare stikker til en svært spesifikk del av identifiserende informasjon.Nucleic-acid amplification tester er utrolig nyttig for STD testing. De tillater leger å oppdage et STD-patogen selv når bare et svært lite antall organismer er til stede. Det er denne typen teknologi som har gjort det mulig å gjøre urinprøving for STD som tidligere kun var påviselig av swab.
Dessuten, siden nukleinsyre-amplifikasjonstester er utrolig følsomme for selv små mengder virus-DNA, er de ytterligere viktige for screening av blodtilførselen. Disse testene gjør det mulig å oppdage små mengder HIV og andre blodbårne patogener som ellers ville bli savnet.
Det er også ikke-forsterket nukleinsyreforsøk tilgjengelig for visse STDs, slik som gonoré og klamydia. Ikke amplifiserte nukleinsyrehybridiseringstester er mer sannsynlig å bli brukt når store mengder bakterielt eller viralt DNA (eller RNA) forventes å være tilstede, som for eksempel i en urinrøret eller i en bakteriekulturprøve. Under slike omstendigheter er det ikke nødvendig med forsterkning. I disse prøvene, hvis DNA eller RNA er tilstede, bør det være tilstede i detekterbare mengder.
Eksempel på denne testen i bruk
Nukleinsyre-amplifikasjonstester er utrolig følsomme metoder for å oppdage om bakterier eller virus er tilstede i en biologisk prøve. Når det gjelder å oppdage kjønnsherpes i sår fra en person som har symptomer, fungerer disse tester som et levedyktig alternativ til en viral kultur. Viralkulturer kan være vanskelig for enkelte laboratorier å utføre. I motsetning til herpes blodprøver innebærer en NAT fortsatt den direkte bestemmelse av om et virus er tilstede i prøven i stedet for å lete etter anti-herpes antistoffer.Nukleinsyreforsterkning har også muliggjort en utvidelse av klamydia og gonoré-screening rundt om i landet. Nå kan slik screening nå gjøres på urinprøver i stedet for å kreve en urinrør eller cervicovaginal swab. Det har således blitt enkelt å teste et stort antall unge menn og kvinner for disse STDene i en rekke både kliniske og ikke-kliniske innstillinger. Innsamling av urin krever ingen medisinsk kompetanse. Folk er også mer sannsynlig å være villige til å tisse i en kopp enn å gjennomgå en kjønnsvullpinne.
Forskere har også brukt nukleinsyre-amplifikasjonstester for å få mer informasjon om omfanget av problemet med asymptomatiske STD i USA. Storskala NAT-baserte screeningsprogrammer er implementert i militæret, i urbane tenåringer, hos menn som har sex med menn, og i andre høyrisiko- og lavrisikogrupper. Disse testene tillater deteksjon av STD i de små urin- eller blodprøver som ofte tas som en del av store studier på befolknings helse.