Polymerase Chain Reaction (PCR) og STD Testing

Polymeraskjedereaksjon (PCR) analyse er en laboratorieteknikk. Formålet med PCR-testing er å finne små mengder DNA i en prøve, ved hjelp av en prosess kjent som forsterkning. Under PCR-amplifikasjon kopieres DNA av interesse flere ganger til det er nok av det til analyse og deteksjon. For eksempel kan PCR brukes til å identifisere små mengder DNA fra organismer som forårsaker gonoré eller klamydia som er tilstede i en urinprøve.

Hvordan virker PCR-arbeid?

Det første trinnet med PCR er å lage primere. Dette er korte sekvenser av DNA som passer opp til enden av DNA-prøven du prøver å oppdage. De er lure for å finne, forsterke og oppdage et bestemt stykke DNA. Det stykke DNA kan brukes til å identifisere et patogen. Det kan også brukes til å gjøre ting som detekterer gener for antibiotikaresistens.
Når du har primere, er det neste trinnet i PCR å varme prøven slik at det dobbeltstrengede DNA skiller seg i to enkle tråder - dette kalles denaturering. Så primerneer kombinert med prøven DNA. Etter dette, et DNA polymerase brukes til å starte DNA-replikasjon ved primerplasseringen. Endelig oppvarmes DNA'et for å separere strengene igjen. Med det begynner hele PCR prosessen igjen.
Mengden av DNA-segmentet av interesse som er tilstede i prøven, øker eksponentielt med hver PCR-syklus. I første syklus blir en kopi to. Da blir to eksemplarer fire, blir deretter åtte, etc. Denne eksponensielle veksten betyr at det vanligvis kun er 20 til 40 sykluser for å avgjøre om det aktuelle DNA er tilstede. (Hvis DNA er tilstede, er 20-40 sykluser også nok til å gi en tilstrekkelig prøve for analyse).
Alle trinnene i en polymerasekjedereaksjon - denaturering av DNA, påføring av primere, og forlengelse av DNA - skjer ved forskjellige temperaturer. Det betyr at etter at den første blandingen er satt sammen, kan trinnene styres gjennom en prosess kjent som termo. Termosirkulering betyr at temperaturen holdes på nødvendige nivåer for bare lenge nok for hvert trinn å skje. Således er PCR en effektiv måte å amplifisere mengden av mål-DNA. Faktisk kan det oppnås i et enkelt reagensrør med lite behov for menneskelig inngrep.
Polymerase kjedereaksjon representerte en revolusjon i biologisk teknikk da den ble utviklet først i begynnelsen av 1980-tallet. PCRs skaperen, Kary Mullis, vant Nobelprisen i kjemi for sitt arbeid i 1993.

Hvorfor PCR er relevant for STD-testing

Polymerasekjedereaksjon, og tilhørende teknikker som ligasekjedereaksjon, viser seg å være av voksende betydning for STD testing. Dette skyldes at disse teknikkene direkte kan identifisere små mengder virus DNA eller RNA i prøver. Identifisering av et patogenes genetiske kode krever ikke at patogenet lever - i motsetning til bakteriekultur eller viral kultur. Det krever heller ikke at infeksjonen har skjedd lenge nok for lenge siden for at folk har utviklet en påviselig antistoffreaksjon (måten infeksjoner oppdages av ELISA.) Dette betyr at PCR-teknikker noen ganger kan oppdage sykdommer tidligere enn andre tester. Enda bedre, STDs kan oppdages uten så mye behov for å være bekymret for å holde prøver levende eller test på akkurat riktig tidspunkt.