Genetiske stammer av HIV-1 og HIV-2

En av de primære hindringene for å behandle eller utvikle effektiv vaksine for HIV er det høye genetiske mangfoldet av selve viruset. Mens virus som bruker dobbeltstrenget DNA for å replikere, er relativt stabile, går retrovirus som HIV tilbake i replikasjons syklusen (ved bruk av enkeltstam-RNA) og er langt mindre stabile. Som et resultat er HIV svært utsatt for mutasjonsmuterende, faktisk ca. en million ganger oftere enn celler som bruker DNA.
Siden virusets genetiske mangfold utvides og ulike virale deltyper blir overført fra person til person, kan det blandede genetiske materialet skape nye HIV-hybrider. Mens de fleste av disse hybrider dør, viser de få overlevende ofte større motstand mot hiv-terapi og i noen tilfeller raskere sykdomsprogresjon.
Hivets variabilitet skaper derfor noe av et "flytende mål" for forskere, med nye rekombinante (kombinert genetiske) stammer som er i stand til å motstå eller helt unnslippe nøytraliserende midler. Noen, som A3 / 02-stammen identifisert av svenske forskere i 2013, er i stand til å tømme en persons immunforsvar langt mer aggressivt enn tidligere kjent stammer.
Hva er HIV-1 og HIV-2?
Det finnes to typer HIV: HIV-1 og HIV-2. HIV-1 regnes som den dominerende typen, som representerer de aller fleste infeksjoner over hele verden, mens HIV-2 er langt mindre vanlig og primært konsentrert i vest- og sentralafrikanske regioner. Selv om begge disse HIV-typene kan føre til aids, er HIV-2 mye vanskeligere å overføre og langt mindre virulent enn HIV-1.
Innenfor hver av disse HIV-typer er en rekke grupper, undertyper ("clades") og sub-subtyper. Utvilsomt vil andre subtyper og rekombinante stammer bli oppdaget etter hvert som det globale spredningen av HIV fortsetter.
HIV-1 grupper og subtyper
HIV-1 er delt inn i fire grupper: Gruppe M (betyr "major"); Gruppe O (som betyr "outlier" eller over hvor andre grupper er sett); og gruppe N (som betyr "ikke-M" og "ikke-O"); og gruppe P (betyr "ventende"). De fire forskjellige gruppene er klassifisert av de fire forskjellige simian immundefekt virusene (SIV) som var kjent for å bli overført fra aper eller sjimpanser til mennesket.
HIV-1-gruppe M
HIV-1 Gruppe M var den første gruppen som ble identifisert, og representerer i dag omtrent 90% av hiv-tilfellene over hele verden og kan finnes nesten i alle deler av verden. Innenfor denne gruppen er det 10 undertyper, som kan stratifiseres blant annet av deres geografiske distribusjon og deres innvirkning på ulike risikogrupper.

Subtype A: sett i Vest-Afrika og påvirker hovedsakelig heteroseksuelle og injiserende narkotikabrukere (IDUer).
Subtype B: Den dominerende subtypen i Europa, Amerika, Japan, Thailand og Australia, som representerer nesten all infeksjon i Nord-Amerika og ca 80% av alle i Europa. Infeksjoner forekommer hos flere blant menn som har sex med menn (MSM) og IDUer enn heteroseksuelle.
Subtype C: beskrevet som den mest utbredte HIV-subtypen som representerer 48% av alle infeksjoner over hele verden, hovedsakelig heteroseksuell og hovedsakelig i Afrika sør for Sahara, India og deler av Kina.
Undertype D: Isolere hovedsakelig i Øst- og Sentral-Afrika.
Subtype E: En subtype som bare settes i en rekombinant form med undertype A.
Subtype F: blant en mindre prosentandel av infeksjoner sett i Sentral-Afrika, Sør-Amerika og Europa.
Subtype G: blant en mindre prosentandel av infeksjoner sett i deler av Afrika og Europa.
Subtype H: blant en mindre prosentandel av infeksjoner sett i Sentral-Afrika.
Undertype J: observert i Nord-, Sentral- og Vest-Afrika og Karibia

Undertype K: Begrenset til Den demokratiske republikken Kongo (DRC) og Kamerun.

HIV-1 Gruppe O
HIV-1 Gruppe O ble oppdaget i 1990 og representerer kun 1% av infeksjonene over hele verden. Denne HIV-gruppen er isolert i Kamerun og nabolandene i Afrika.
HIV-1 Gruppe N
HIV-1-gruppe N ble oppdaget i 1998, og igjen har det bare blitt sett i Kamerun med mindre enn 20 tilfeller dokumentert til dags dato.
HIV-1 Gruppe P
HIV-1 Gruppe P er sjelden type HIV, som først ble identifisert i en kvinne fra Kamerun i 2009. Den kan differensieres fra andre HIV-grupper, forutsatt at dens opprinnelse har vært knyttet til en form for SIV som finnes i vestlige gorillaer. Selv om "P" -klassifiseringen var ment å utlede en "ventende" status (dvs. venter på bekreftelse av ytterligere infeksjon), ble en andre dokumentert sak identifisert i 2011 i en kameramansk mann.
HIV-2-grupper
Selv om tilfeller av HIV-2 er blitt identifisert andre steder, er infeksjoner nesten utelukkende sett i Afrika. Det er for tiden åtte HIV-2-grupper, men bare undertyper A og B er de eneste som anses som epidemier. HIV-2 antas å ha kryssede arter fra en type SIV som påvirker sooty mangabeys ape direkte til mennesker.
HIV-2-gruppe A er hovedsakelig sett i Vest-Afrika, men internasjonal reise har ført til en liten håndfull dokumenterte tilfeller i USA, Europa, Brasil og India. Derimot har HIV-2 Gruppe B vært begrenset til deler av Vest-Afrika.